显卡
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游戏玩家必备：免费杀毒软件推荐与系统优化技巧
作为游戏玩家，我们都希望电脑既能提供丝滑的游戏体验，又能确保系统安全。面对杀毒软件可能占用资源、影响帧数的担忧，以及后台程序干扰游戏的困扰，这里有一些实用的解决方案。 一、免费且轻量的杀毒软件推荐 市面上确实有几款专为游戏玩家...
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笔记本电脑卡顿？除了加内存换硬盘，这些低成本软件优化也很有用！
哈喽大家好！是不是觉得自己的笔记本电脑用久了就感觉慢吞吞的，开个程序都得等半天？想升级内存和固态硬盘又觉得麻烦或者没预算？别担心，我最近就捣鼓了一番我的老伙计，发现有些软件层面的优化，效果也很惊喜！今天就来分享下除了加内存、换固态硬盘之外...
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PVE 硬件直通避坑指南：打破 IOMMU 分组限制，实现 PCIe 设备完美独立直通
在玩 Proxmox VE (PVE) 虚拟机直通（比如直通显卡做 HTPC/AI 绘图，或者直通多口网卡做软路由）时，很多人都会遇到一个极其恶心的“连坐”问题： 想把网卡 A 直通给 OpenWrt，网卡 B 直通给 TrueNA...
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不止PTM7950：盘点那些悄然进击笔电/显卡供应链的国产相变导热“黑马”
几年前，“相变导热垫”（Phase Change Thermal Pad）还是莱尔德（Laird）、霍尼韦尔（Honeywell）等国际大厂的专属领域。直到以 PTM7950 为代表的国产高性能型号凭借实测中媲美甚至超越顶级硅脂的表现...
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白嫖云端算力：如何用免费 Google Colab 运行 GPU 加速的 GROMACS 分子动力学模拟
对于从事计算生物学或计算化学的研究生和科研人员来说，本地缺乏高性能 GPU 算力是一个长期存在的痛点。Google Colab 提供的免费 T4 GPU 是一个极佳的“白嫖”资源。 本文将手把手带你配置 Google Colab 环境...
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显存不够也能玩转AI制药：本地低配环境搭建 RFdiffusion + ProteinMPNN 工作流指南
作为蛋白质 de novo 设计领域的“黄金搭档”，RFdiffusion（负责骨架生成）和 ProteinMPNN（负责序列设计）几乎是目前计算生物学研究的标配。然而，官方文档中动辄要求 A100 或 24G 显存显卡的配置，让许多只有...
476 蛋白质设计 -
为什么你的RTX 4090跑GROMACS快不起来？盘点最影响GPU计算效率的MDP参数
很多人在服务器上配置了昂贵的 A100 或是最新的 RTX 4090 显卡，但在运行 GROMACS 模拟时，却发现 GPU 占用率长期在 30% 到 50% 之间徘徊，跑出来的 ns/day 数据甚至不如低端显卡。 这种现象大概率不...
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AlphaFold 3 开源了却动不了？无 GPU 预算的生信避坑与替代工作流指南
不少做结构生物学和药物研发的同学最近都在关注 AlphaFold 3 (AF3) 的开源进展。 好消息是，DeepMind 在 2024 年 11 月终于迫于学术界压力，正式开源了 AlphaFold 3 的源代码和模型权重（仅限...
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如何本地免商业授权费部署 AlphaFold 3？（附抗体-抗原复合物预测实操指南）
Google DeepMind 在 2024 年 11 月正式开源了 AlphaFold 3 (AF3) 的源代码及模型权重（针对学术与非商业用途）。这意味着研究人员终于可以摆脱 Web 服务器每天的提交限制，在本地环境中运行这一顶尖...
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单卡 RTX 4090 本地部署 AlphaFold 3 实操与显存优化指南
Google DeepMind 正式开源 AlphaFold 3 (AF3) 的源代码和模型权重后，生命科学与 AI 交叉领域的开发者迎来了一波本地部署热潮。 虽然官方推荐使用 A100/H100 等企业级显卡，但对于预算有限的个人开...
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普通用户备份系统，真的需要创建整个镜像吗？试试这个更轻量的方法
很多普通用户在重装系统后，会习惯性地使用“系统镜像”功能备份整个系统分区。但正如你所说，对于非专业用户，这真的有必要吗？一个完整的系统镜像通常占据数十GB甚至上百GB的空间，恢复过程也相对缓慢。更重要的是，如果只是日常使用，我们真正需要备...
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双路服务器 PVE 虚拟机游戏惨烈掉帧？手把手教你配置 NUMA 绑定与 CPU 亲和性
很多用双路至强（Xeon）或双路 EPYC 组装家用服务器的玩家，在 PVE（Proxmox VE）下直通显卡给 Windows 虚拟机玩游戏时，都会遇到一个玄学问题： 显卡配置明明很高，但游戏内频繁出现周期性的卡顿、严重掉帧（甚至...
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PVE 8.0下Intel 12代及以上核显SR-IOV虚拟化实操教程（保留宿主机HDMI输出）
在 Intel 11 代之前的消费级平台上，我们常用 GVT-g 技术来对核显进行分片虚拟化。但从 12 代（Alder Lake）及以后的架构（包括 N100、i3-12100、i7-13700 等）开始，Intel 彻底废弃了 GVT...
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如何用 ESM-2 进行抗体-抗原结合亲和力预测？从零样本表征到微调实操
在 AI 辅助抗体药物研发（AIDD）中，评估抗体与抗原之间的结合亲和力（Affinity）是核心环节。Meta 团队开源的 ESM-2 作为目前最强大的蛋白质语言模型之一，凭借其在海量无标注蛋白质序列上学习到的进化和物理化学规律，成...
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白嫖 Colab：如何无显卡（纯CPU）免费预测超长单链蛋白质结构？
在结构生物学界，预测超长单链蛋白（比如 >1000 个氨基酸）一直是个“吞金兽”级别的任务。 很多人习惯用 ColabFold (AlphaFold2)。但如果你试过在 Colab 的免费 T4 GPU 上跑 1200aa 以上...
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橡皮筋悬空硬盘、风扇怼着吹：盘点那些年我们试过的“硬核”养护法
你是否也曾为了心爱的硬盘或主机散热绞尽脑汁，尝试过一些听起来很“野”的路子？比如用几根橡皮筋把硬盘吊在机箱里，或者拿个桌面风扇直接对着机箱猛吹？ 这些方法看似解决了眼前的问题（震动、高温），但它们真的靠谱吗？今天我们就来掰扯掰扯几种流...
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单GPU多MPI跑GROMACS：如何通过NVIDIA MPS优化性能并彻底避免显存溢出
在利用高性能计算（HPC）集群运行分子动力学模拟时，GROMACS 凭借其对 GPU 的高效支持成为了行业标配。然而，在实际生产环境中，我们经常会遇到这样的尴尬场景： 当模拟的体系较小（如少于 10 万原子），或者 CPU 核心数较...
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半导体制冷之外：五种已走进现实的微型“冷科技”
当我们需要给一个小空间降温——比如一台高性能迷你电脑的CPU、一个便携式药品箱，或者一套VR眼镜的显示模块——半导体制冷片往往是首选。但它发热大、能效低的缺点也很明显。其实，工程师们已经在探索其他路径。下面几种方案，有的已经藏在你的电子产...
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白嫖 Meta 算力：无显卡如何在 Colab 快速部署 ESMFold 并搞定单点突变分析
做结构生物学和计算生物学的同学，或多或少都经历过被显卡支配的恐惧。想跑个 AlphaFold2，光是配环境和下载那几个 TB 的数据库就能让人崩溃，更别提本地那块瑟瑟发抖的 RTX 3060 显卡了。 其实，如果你只是想针对某个靶点蛋...
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突破通信瓶颈：vLLM 混合并行与 K8s 拓扑感知调度深度实践
在大规模 LLM（如 Llama-3-70B、Mixtral-8x22B 等）推理场景下，基于 vLLM 的分布式推理服务面临着极其严苛的时延挑战。 Tensor Parallelism（张量并行，简称 TP）由于在每个 Transf...
