抗体虚拟筛选
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如何用 AlphaFold-Multimer 落地抗原与海量天然抗体文库的盲筛对接管线
在没有已知抗体作为阳性对照的情况下,直接使用 AlphaFold-Multimer (AFM) 对数万甚至数百万个天然抗体序列进行盲筛对接,在计算资源(GPU 算力)和时间成本上是极不现实的。标准 AFM 预测一个抗原-抗体复合物通常...
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别再用ColabFold做万级筛选了:超高通量抗体-抗原盲对接的几何深度学习工具指南
在抗体药物研发的早期阶段,面对数十万个候选抗体序列, ColabFold(基于 AlphaFold-Multimer)的推断速度是无法承受的。 尽管它的精度极高,但其庞大的参数量和自注意力机制的时间复杂度,导致单次对接耗时通常在数分钟到...