实验室
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N100 独显级折腾：Jellyfin 在 SR-IOV 虚拟显卡下 H.265 10bit 转码 HDR 偏色的终极解决方案
在使用 Intel N100 处理器（Alder Lake-N）搭建 Home Lab 时，通过 SR-IOV 技术将核显虚拟化出多个 VF（Virtual Function）分给 Jellyfin、iStoreOS 或 PVE 虚拟...
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AlphaFold 3 开源了却动不了？无 GPU 预算的生信避坑与替代工作流指南
不少做结构生物学和药物研发的同学最近都在关注 AlphaFold 3 (AF3) 的开源进展。 好消息是，DeepMind 在 2024 年 11 月终于迫于学术界压力，正式开源了 AlphaFold 3 的源代码和模型权重（仅限...
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显存不够怎么跑 RoseTTAFold2？超大蛋白质复合物轻量化预测实战
生命科学领域的研究者，大概都经历过被 CUDA out of memory （显存溢出）支配的恐惧。 随着结构生物学进入“大复合物时代”，预测 2000aa（氨基酸残基）以上的超大蛋白质复合物已成常态。然而，RoseTTAFold2...
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单卡 RTX 4090 本地部署 AlphaFold 3 实操与显存优化指南
Google DeepMind 正式开源 AlphaFold 3 (AF3) 的源代码和模型权重后，生命科学与 AI 交叉领域的开发者迎来了一波本地部署热潮。 虽然官方推荐使用 A100/H100 等企业级显卡，但对于预算有限的个人开...
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如何本地免商业授权费部署 AlphaFold 3？（附抗体-抗原复合物预测实操指南）
Google DeepMind 在 2024 年 11 月正式开源了 AlphaFold 3 (AF3) 的源代码及模型权重（针对学术与非商业用途）。这意味着研究人员终于可以摆脱 Web 服务器每天的提交限制，在本地环境中运行这一顶尖...
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抗体非特异性结合（NSB）筛查：如何选择与应用开源抗体蛋白质语言模型（pLM）
在治疗性抗体开发中，非特异性结合（Non-Specific Binding, NSB）或多反应性（Polyreactivity）是导致候选药物在体内药代动力学（PK）性质差、清除率快以及毒性升高的主要原因之一。 利用蛋白质语言模型（p...
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除了AlphaFold 3，现代AI药物设计管线里还有哪些不可或缺的底层模型？
在AI制药（AIDD）领域，AlphaFold 3毫无疑问是聚光灯下最耀眼的明星。它解决了“结构预测”这一历史性难题。然而，药物研发是一个漫长且复杂的系统工程，从靶点发现、先导化合物筛选、结构优化到ADMET（吸收、分布、代谢、排泄和毒性...
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AlphaFold 3 都能预测配体结合了，为什么 AI 制药公司还要砸钱做湿实验？
在生物医药和 AI 交叉领域，AlphaFold 3（AF3）的发布无疑是一场地震。它不仅能预测蛋白质结构，还能预测蛋白质与小分子配体、DNA、RNA 的复合物结构。 这时候，很多行外人（甚至不少投资人）都会产生一个极其自然的疑问： ...
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那些曾经靠「解结构」坐拥 CNS 的实验室，在 AlphaFold 3 时代都转型去哪了？
AlphaFold 3（AF3）的开源，尤其是它对蛋白质-核酸、蛋白质-小分子配体、修饰性化学基团复合物预测能力的跃升，确实给传统结构生物学界带来了一场海啸。 在几年前，冷冻电镜（Cryo-EM）刚普及的“黄金时代”，一个课题组只要能...
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AlphaFold 3 迟到的开源：学术界的全面狂欢，与工业界尴尬的“围城”
从今年 5 月在《Nature》发表论文时仅提供限制重重的 Web 服务器，到 11 月正式释放完整源代码和模型权重，DeepMind 的这一百八十度大转弯，无疑是今年 AI for Science 领域最重磅的戏剧性事件。 对于这个...
284 DeepMind -
AlphaFold 3 开源学术权重后，AI 制药创业公司靠什么活下去
Google DeepMind 终究还是向学术界低了头。 AlphaFold 3（以下简称 AF3）的源代码和学术权重正式开源。这一举动，把大半年前因“仅提供 Web 服务器、限制每日调用、不给权重”而引发的学术界怒火彻底平息，但也顺...
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除了转录因子，高通量筛选在非编码RNA与调控元件中还有哪些高价值应用？
在分子生物学和基因治疗领域，高通量筛选（High-Throughput Screening, HTS）早就不再局限于“转录因子（TF）-靶启动子”这种经典的蛋白质-DNA相互作用模式。 随着大规模并行报告基因分析（MPRA）、CRIS...
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基于介电泳‑电穿孔协同的植物叶肉原生质体高通量转染体系
引言：从叶肉到田间的加速器 在作物改良的赛道上，功能基因组学团队最头疼的不是找不到候选基因，而是 验证速度跟不上筛选速度 。传统PEG化学法转染原生质体，操作员得像绣花一样逐个处理，培养皿里一群脆弱的"裸核"随时可...
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微流控芯片结合AI视觉的海月水母单胚胎CRISPR高效注射系统
研究背景与意义 海月水母（Aurelia aurita）作为刺胞动物门的代表物种，因其透明的早期胚胎、清晰的发育过程以及强大的再生能力，已成为研究细胞命运决定、神经发育和再生的重要模式生物。然而，传统的手动显微注射方法在水母胚胎中的应...
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海月水母CRISPR热休克启动子编辑与活体荧光成像：潮间带模式物种的温度响应研究全流程
引言：为什么选择海月水母和hsp启动子？ 海月水母( Aurelia coerulea )近年来迅速崛起为潮间带海洋无脊椎动物研究的明星模式生物。它的胚胎高度透明、发育速度快（受精后数小时即可观察）、且在自然界中广泛分布，这些特点使其...
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酶活性测定能否替代分子标记判断珊瑚苗期的能量代谢来源
问题的核心张力 在珊瑚早期生活史研究中，判断幼体能量来源（自养 vs 异养）通常依赖分子手段——最常见的是通过qPCR定量 Symbiodiniaceae 密度，或用转录组/宏基因组分析代谢通路基因表达。但你敏锐地指出了这类方法的内在...
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磁吸轨道钉值不值得买？看完这篇再决定
先搞清楚这东西到底是什么 说白了，磁吸轨道钉就是一根带磁性底座的轨道条，搭配各种可拆卸的挂钩配件。它不需要打孔、不需要胶水，直接靠磁力吸附在冰箱、金属橱柜、油烟机这些金属表面上，用来挂东西。 最早是从韩国那边火起来的，最初设计是给...
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阳台美缝总发黄？除了环氧彩砂，这两种高性能材料才是户外和采光区的“救星”
很多装修过的人都有这种困扰：斥巨资做了环氧彩砂，结果阳台、落地窗边不到一年就变黄、变脆甚至脱落。 其实这不能怪工人手艺，而是 环氧树脂（Epoxy）本身的物理特性缺陷——极度怕紫外线。 环氧分子结构中的芳香醚键在紫外线照射下会发生降...
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别再乱买洗碗机耗材了！洗碗粉、洗碗块、凝珠究竟哪个更划算？
自从家里装了洗碗机，很多朋友最纠结的不是洗碗机本身好不好用，而是那堆花里胡哨的耗材。洗碗粉、洗碗块、洗碗凝珠，价格天差地别，到底是真的有技术门槛，还是商家在收“智商税”？ 作为一名用了5年洗碗机、试过不下20种耗材的“家电重度用户”，...
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红木市场水深几许？从“国标”到“潜规则”，教你练就火眼金睛
在家具圈，红木一直是个“水极深”的领域。很多消费者揣着几十万进场，最后搬回家的可能只是一堆披着红木皮的“杂木”。 常有人问： “到底什么才算真红木？” 要回答这个问题，不能听销售天花乱坠的吹嘘，得先从那张“准入证”说起。 ...
