孤波
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那些曾经靠「解结构」坐拥 CNS 的实验室,在 AlphaFold 3 时代都转型去哪了?
AlphaFold 3(AF3)的开源,尤其是它对蛋白质-核酸、蛋白质-小分子配体、修饰性化学基团复合物预测能力的跃升,确实给传统结构生物学界带来了一场海啸。 在几年前,冷冻电镜(Cryo-EM)刚普及的“黄金时代”,一个课题组只要能...
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如何用 ESM-2 进行抗体-抗原结合亲和力预测?从零样本表征到微调实操
在 AI 辅助抗体药物研发(AIDD)中,评估抗体与抗原之间的结合亲和力(Affinity)是核心环节。Meta 团队开源的 ESM-2 作为目前最强大的蛋白质语言模型之一,凭借其在海量无标注蛋白质序列上学习到的进化和物理化学规律,成...
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榨干 RocksDB 性能:如何通过 Write Buffer Manager 优雅平衡内存与 Flush 效率?
在基于 LSM-Tree(Log-Structured Merge-tree)架构的存储引擎(如 RocksDB、Pebble)中, MemTable 是承接写入流量的第一站。为了防止内存无限膨胀导致 OOM(Out of Memory...