物信息学
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NMF算法家族大揭秘：稀疏、正交…它们都有啥绝活？
NMF（非负矩阵分解）就像一位魔术师，能把一个大杂烩矩阵拆成两个小而美的矩阵。但这位魔术师可不止一招！今天，咱就来聊聊NMF的各种“变身”，看看它们都有啥独门绝技，又适合在哪些场合“表演”。 咱们先简单回顾下NMF的基础。想象一下，你...
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GNMF算法加速：LSH在处理大规模图像数据集中的应用
GNMF算法加速：LSH在处理大规模图像数据集中的应用 大家好啊！今天咱们聊聊一个听起来有点“高大上”，但实际上跟图像处理息息相关的话题——GNMF（图正则化非负矩阵分解）算法，以及如何用局部敏感哈希（LSH）来给它“提提速”。 ...
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从“只给网页”到“开源代码”：AlphaFold 3 的妥协、社区自救与AI制药的权力重构
2024 年 5 月，DeepMind 在《Nature》上发表了 AlphaFold 3（AF3），宣称其不仅能预测蛋白质，还能预测 DNA、RNA 以及化学小分子配体的复合物结构。然而，伴随这项里程碑式成果而来的，不是欢呼，而是一场结...
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单卡跑通万级突变：本地轻量化 ESMFold 部署与高通量筛选实战
在蛋白质工程和定向进化中，对成百上千个突变体进行结构预测是一项常见的任务。传统的 AlphaFold2 尽管精度极高，但由于需要进行耗时的 MSA（多序列比对）检索，在面对高通量突变体筛选时，算力成本和时间周期往往难以接受。 Meta...
